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系統發育模型錯置

當推斷模型有結構性錯置時,更多 DNA 會否提高對錯誤拓撲的信心?

可重現研究更新於 2026年7月30日
系統發育模型錯置的技術圖像
由私人技術工作區同步並經審閱的研究圖像;原有比例與標示獲完整保留。

編輯導覽

當更多 DNA 令錯誤的演化樹更確定〉完整分開抽樣與模型誤差,展示組成嚴重度地圖、bootstrap 解讀、四幅核准圖及實用模型適足性流程。

主要結果

  • 異質生成器在 5000 位點時,p-distance、JC69 與 K80 在 120 條比對中 0 次恢復真實分割;正則化 log-det 為 120 次。
  • 選定比對在不同距離模型下,對互不相容分割都可產生完整 bootstrap 支持。

限制

  • 四物種樹與異質過程是刻意設計的示範。
  • 研究沒有證明正則化 log-det 普遍優越。

技術紀錄

詳細程式、計算、生成圖像及重現說明存放於私人技術工作區。公開文章只包含人工審閱的解讀與核准圖像,不會由同步程序改寫正文。

版本紀錄

2026-07-30 — 已按技術證據重新審閱繁體中文概覽。